搭配高输出阵容的核心在于合理选择忍者属性与技能联动。忍者从橙色五星级上分为SSS、SS、S级，其中SSS级忍者稀有度最高且强度突出，应优先作为阵容核心。属性分类上分为智、勇、心、技、体五种，均衡搭配不同属性的忍者能触发额外增益效果。例如三智阵容可能激活智力共鸣，而混搭勇、技属性则能弥补单一属性的短板。高输出阵容通常需要至少1-2名SSS级主C忍者，搭配辅助型忍者提供控制或增益。
高输出阵容的构建需注重技能链的连贯性。忍者的追打技能是连招的关键，例如倒地追打可衔接浮空技能，形成多段伤害。部分忍者拥有被动技能可提升全队暴击率或攻击力，这类忍者即使本身输出不高，也能大幅提升队伍整体爆发。奥义技能的释放时机尤为重要，优先选择冷却短或附带增益效果的奥义，确保在关键回合打出爆发。部分忍者组合能通过特定技能触发额外效果，例如咒印队通过结界叠加伤害，或菜刀队依赖普攻连击快速清场。
SSS级忍者可通过组织商店、积分商店或限时招募获取，而爬塔玩法达到特定关卡也能领取。前期若资源有限，可用SS级忍者过渡，例如大蛇丸、宇智波佐助等易获取且强度稳定的角色。养成时应优先提升主C忍者的星级与装备，辅助型忍者则侧重技能等级。注意避免将资源浪费在紫色四星忍者上，这类忍者通常仅作为养成材料，缺乏实战价值。
高输出阵容往往防御较弱，因此需利用控制技能限制敌方行动，或通过护盾、治疗类技能提高生存能力。例如土主的多重硬化术可为全队提供护盾，搭配钢体被动免疫不良状态；风主的分身术则能吸引火力。面对高爆发对手时，可牺牲部分输出位，换用防御型忍者拖延节奏。属性克制关系能显著影响战局，火属性阵容对阵风属性时会有天然优势，需提前观察敌方阵容并针对性调整。
随着游戏进度推进，需逐步替换过渡忍者，向纯SSS级阵容靠拢。例如五影队或宇智波队等顶级搭配，虽然成型较慢，但后期上限极高。定期测试新忍者组合，挖掘隐藏的技能联动，例如部分冷门忍者在特定体系中能发挥超模效果。保持对版本趋势的敏感度，但不必盲目跟风，选择适合自身操作习惯的阵容才能最大化输出效率。
